O Ano é 2029, e humanos mecanicamente aprimorados são considerados exilados, vivendo totalmente segregados do resto da sociedade.
Agora, o experiente agente disfarçado Adam Jensen é forçado a agir em um mundo intolerante. Armado com um novo arsenal de modernas armas e aprimoramentos, ele deve prosseguir com cautela, escolhendo com cuidado os seus aliados, para desvendar uma enorme conspiração mundial.